Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Plod1Q9R0E2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms