Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkab1Q9R078 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms