Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms