Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Col4a3Q9QZS0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms