Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms