Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt3Q9QZ47 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnnt3Q9QZ47 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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