Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR7

Acot3, Acyl-coenzyme A thioesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acot3Q9QYR7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms