Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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ChmQ9QXG2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ChmQ9QXG2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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ChmQ9QXG2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ChmQ9QXG2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ChmQ9QXG2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ChmQ9QXG2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ChmQ9QXG2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ChmQ9QXG2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ChmQ9QXG2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ChmQ9QXG2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ChmQ9QXG2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ChmQ9QXG2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmQ9QXG2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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