Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limd1Q9QXD8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms