Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chaf1aQ9QWF0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms