Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfmbt1Q9JMD1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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