Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SrfQ9JM73 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SrfQ9JM73 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SrfQ9JM73 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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