Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Rabgef1Q9JM13 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Rabgef1Q9JM13 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Rabgef1Q9JM13 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Rabgef1Q9JM13 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Rabgef1Q9JM13 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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