Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CubnQ9JLB4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms