Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg3Q9JL95 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms