Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn5Q9JL35 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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