Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms