Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
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DysfQ9ESD7 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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DysfQ9ESD7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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DysfQ9ESD7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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DysfQ9ESD7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DysfQ9ESD7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms