Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc4Q9ES56 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms