Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms