Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms