Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xab2Q9DCD2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xab2Q9DCD2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms