Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Hmgn3Q9DCB1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Hmgn3Q9DCB1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Hmgn3Q9DCB1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Hmgn3Q9DCB1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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