Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 1700019E08Rik-201ENSMUST00000134308 424 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm16618-201ENSMUST00000134992 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Lrrc3b-203ENSMUST00000223700 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm17042-201ENSMUST00000167075 1216 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms