Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms