Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmtr1Q9DBC3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtr1Q9DBC3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms