Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med27Q9DB40 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med27Q9DB40 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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