Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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