Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph3bQ9DA80 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms