Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco2Q9DA21 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smco2Q9DA21 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms