Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp12Q9D9M2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms