Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot8Q9D8X5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms