Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi35Q9D8C4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms