Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Cldn23Q9D7D7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cldn23Q9D7D7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cldn23Q9D7D7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cldn23Q9D7D7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cldn23Q9D7D7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cldn23Q9D7D7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
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Cldn23Q9D7D7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cldn23Q9D7D7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cldn23Q9D7D7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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