Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms