Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr42e1Q9D665 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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