Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms