Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrameQ9D4Z5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrameQ9D4Z5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrameQ9D4Z5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrameQ9D4Z5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrameQ9D4Z5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PrameQ9D4Z5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrameQ9D4Z5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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PrameQ9D4Z5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PrameQ9D4Z5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrameQ9D4Z5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrameQ9D4Z5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrameQ9D4Z5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrameQ9D4Z5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrameQ9D4Z5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrameQ9D4Z5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PrameQ9D4Z5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrameQ9D4Z5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PrameQ9D4Z5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrameQ9D4Z5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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PrameQ9D4Z5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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PrameQ9D4Z5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrameQ9D4Z5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrameQ9D4Z5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrameQ9D4Z5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrameQ9D4Z5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrameQ9D4Z5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrameQ9D4Z5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrameQ9D4Z5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrameQ9D4Z5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrameQ9D4Z5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrameQ9D4Z5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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