Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc105Q9D4K7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms