Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms