Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrp2bpQ9D4C6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrp2bpQ9D4C6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrp2bpQ9D4C6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrp2bpQ9D4C6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrp2bpQ9D4C6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrp2bpQ9D4C6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrp2bpQ9D4C6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrp2bpQ9D4C6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrp2bpQ9D4C6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrp2bpQ9D4C6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrp2bpQ9D4C6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrp2bpQ9D4C6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrp2bpQ9D4C6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrp2bpQ9D4C6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrp2bpQ9D4C6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms