Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms