Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Snx29Q9D3S3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Snx29Q9D3S3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Snx29Q9D3S3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Snx29Q9D3S3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Snx29Q9D3S3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Snx29Q9D3S3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Snx29Q9D3S3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Snx29Q9D3S3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms