Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms