Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ube2cQ9D1C1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ube2cQ9D1C1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ube2cQ9D1C1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ube2cQ9D1C1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ube2cQ9D1C1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms