Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ss18l2Q9D174 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms