Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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