Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms