Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ssbp3Q9D032 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ssbp3Q9D032 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ssbp3Q9D032 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ssbp3Q9D032 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ssbp3Q9D032 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ssbp3Q9D032 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ssbp3Q9D032 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp3Q9D032 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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