Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Xrcc3Q9CXE6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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